Le système lagunaire de Lomé révèle une forte contamination des eaux du système en « éléments chimiques et en micro-organismes potentiellement pathogènes qui peuvent être à l’origine de nuisances environnementales et de risques sanitaires significatifs ». Révèle une étude physicochimique publiée en mai 2015 dans le « European Scientific Journal » sur la pollution des eaux.
L’étude menée par des chercheurs de l’Université de Lomé et de Limoges Cedex (France) indique que les eaux du canal présentent une teneur élevée en matières organiques dissoutes, en azote (15mg/l), en phosphore (1,27 mg/l), en permanganate (17,1mg/l) ainsi que des Eléments Traces Métalliques (ETM) et des Matières En Suspension (MES).
« La forte proportion de matières organiques entraîne une faible teneur en oxygène (1,5mg/l alors que la teneur minimale est 2mg/l, ndlr); ce qui a un effet négatif sur l’écosystème aquatique » souligne l’étude.
« Il y a donc de fortes probabilités que les systèmes d’eaux dans la zone du canal lagunaire soient contaminés ainsi que les produits halieutiques provenant du canal » précisent les chercheurs.
Cette pollution est essentiellement d’origine anthropique selon les chercheurs. À côté de la défécation à l’air libre et l’érection des dépotoirs intermédiaires aux abords du canal, l’étude pointe du doigt le système d’évacuation de déchets « inapproprié » mis en place par les ménages situés dans la zone.